לירן כרמל
| לידה | 7 באוגוסט 1971 (גיל: 53) |
|---|---|
| ענף מדעי | ביולוגיה חישובית, אבולוציה מולקולרית, דנ"א עתיק |
| מקום מגורים | שוהם, ישראל |
| מקום לימודים | אוניברסיטת תל אביב, הטכניון - מכון טכנולוגי לישראל, מכון ויצמן למדע |
| מוסדות | האוניברסיטה העברית בירושלים |
| פרסים והוקרה | פרס מסרי (2021), מחזיק בקתדרה לגנטיקה ע"ש סניידר גרנדר |
| http://carmelab.huji.ac.il | |
לירן כרמל (נולד ב-7 באוגוסט 1971) הוא מדען ישראלי, פרופסור מן המנין לביולוגיה חישובית במכון למדעי החיים על שם אלכסנדר סילברמן באוניברסיטה העברית. זוכה פרס מסרי לשנת 2021 על מחקריו בתחום DNA עתיק (אנ').
קורות חיים
כרמל נולד וגדל בישראל. הוא למד תואר ראשון בפיזיקה באוניברסיטת תל אביב במסגרת העתודה האקדמית, ושירת בצה"ל כפיזיקאי ברפא"ל. את התואר השני בפיזיקה קוונטית עשה בטכניון תוך כדי שירותו הצבאי, בהנחיית פרופסור עדי מן. לאחר שירותו הצבאי, עשה דוקטורט במתמטיקה ומדעי המחשב במכון ויצמן תחת הנחייתו של פרופסור דוד הראל. בדוקטורט עבד על אלגוריתמים לקידוד ודיגיטיזציה של ריחות, ואף היה ראש צוות האלגוריתמים בחברה שפיתחה טכנולוגיה להעברת ריחות דרך המחשב. בשנת 2004 יצא ללימודי בתר דוקטורט במכונים הלאומיים לבריאות של ארצות הברית (NIH) שבבת'סדה, מרילנד, שם התמחה בתחום האבולוציה המולקולרית בקבוצת המחקר של יוג'ין קונין.
בשנת 2008 שב לישראל והקים את מעבדת המחקר לביולוגיה חישובית באוניברסיטה העברית, במחלקה לגנטיקה שבמכון למדעי החיים על שם אלכסנדר סילברמן. בשנת 2016 הוזמן לשמש כפרופסור אורח באוניברסיטת ניו-סאות' ווילס (UNSW) בסידני, אוסטרליה, שם שהה כשנה.
כרמל נשוי לענת גלעד-כרמל, אב לשלושה ומתגורר בשוהם.
מחקר
כרמל עורך מחקר חישובי בתחומי האבולוציה המולקולרית, בדגש על חקר האבולוציה של האדם ודנ"א עתיק. הוא פרסם עשרות מאמרי מחקר בתחומים אלו.
בשנת 2014, בשיתוף עם פרופסור ערן משורר, פיתח שיטה חישובית לשחזור תבניות של מתילציית דנ"א (מנגנון אפיגנטי מרכזי) מתוך רצפי דנ"א עתיק. הוא הפעיל שיטה זו על דנ"א עתיק מניאנדרטלים ודניסובים וכך היה לראשון ששחזר תבניות אפיגנטיות של קבוצות אדם קדומות, וזיהה גנים אשר מתבטאים בהם בצורה שונה מאשר בבני אדם מודרניים.[1] בין גנים אלו היו רבים שמתבטאים במוח, וקשורים במחלות נוירולוגיות כמו אלצהיימר, אוטיזם וסכיזופרניה. עבודה זו נבחרה על ידי כתב העת Archaeology כאחת מעשר התגליות המדעיות החשובות של 2014.[2]
בשנת 2017 פיתח כלי חישובי המאפשר לזהות איברי גוף המושפעים באופן מועדף משינויים בביטוי של גנים.[3] כלי זה מאפשר להבין כיצד שינויים אבולוציוניים בדרך פעולתם של גנים משפיעים על גוף האדם. בשנת 2020, בשילוב של כלי זה עם מחקריו על תבניות מתילציית דנ"א בבני אדם קדומים הצליח כרמל, בשיתוף עם פרופסור ערן משורר, להראות שהמבנה האנטומי של תיבת הקול והפנים של האדם המודרני אינה זהה לזה של ניאנדרטלים ודניסובים,[4] מה שמצביע על תהליכים מרתקים שקרו באלפי השנים האחרונות והשפיעו על תיבת הקול המודרנית שלנו.
בשנת 2020 פרסם כרמל מחקר על הדנ"א של הכנענים.[5] במחקר זה ריצף דנ"א מעשרות כנענים שחיו בלבנט הדרומי בתקופת הברונזה, באתרים כמו מגידו, חצור ועוד. כרמל מצא שהכנענים הם תוצאה של ערבוב גנטי, שהתרחש לאורך מאות רבות של שנים, של אוכלוסיות מקומיות עם מהגרים שהגיעו מצפון-מזרח, מאזורים שהיום נמצאים במערב איראן ובקווקז. כרמל גם מצא שהכנענים ביישובים השונים שבדק ברחבי הלבנט הדרומי היו כולם בני אותה אוכלוסייה גנטית. במחקר זה כרמל פיתח שיטה[6] באמצעותה הראה שלאוכלוסיות עתיקות מאזורי הלבנט, הקווקז ומערב איראן תרומה גנטית משמעותית לעמים רבים שחיים היום בלבנט הדרומי, כולל קבוצות שונות של יהודים ושל דוברי ערבית.
פרסים
- פרס גולדה מאיר לשנת 2009.
- פרס פרקש לחוקרים צעירים לשנת 2013.
- פרס ע"ש מיכאל מילקן לשנת 2019.[7]
- בשנת 2021 זכה לירן כרמל בפרס מאסרי על תרומתו לחקר הדנ"א העתיק, ביחד עם פרופסור סבנטה פאבו ופרופסור דיוויד רייך.
קישורים חיצוניים
- דף הבית של כרמל באוניברסיטה העברית.
- לירן כרמל, באתר קהילת המוח הירושלמית.
- לירן כרמל,באתר גוגל סקולר.
- לירן כרמל, המכון למדעי החיים ע"ש אלכסנדר סילברמן.
הערות שוליים
- ^ David Gokhman, Eitan Lavi, Kay Prüfer, Mario F. Fraga, José A. Riancho, Janet Kelso, Svante Pääbo, Eran Meshorer, Liran Carmel, Reconstructing the DNA Methylation Maps of the Neandertal and the Denisovan, Science 344, 2014-05-02, עמ' 523–527 doi: 10.1126/science.1250368
- ^ Top 10 Discoveries of 2014 - Archaeology Magazine, www.archaeology.org
- ^ David Gokhman, Guy Kelman, Adir Amartely, Guy Gershon, Shira Tsur, Liran Carmel, Gene ORGANizer: linking genes to the organs they affect, Nucleic Acids Research 45, 2017-04-21, עמ' W138–W145 doi: 10.1093/nar/gkx302
- ^ David Gokhman, Malka Nissim-Rafinia, Lily Agranat-Tamir, Genevieve Housman, Raquel García-Pérez, Esther Lizano, Olivia Cheronet, Swapan Mallick, Maria A. Nieves-Colón, Heng Li, Songül Alpaslan-Roodenberg, Mario Novak, Hongcang Gu, Jason M. Osinski, Manuel Ferrando-Bernal, Pere Gelabert, Iddi Lipende, Deus Mjungu, Ivanela Kondova, Ronald Bontrop, Ottmar Kullmer, Gerhard Weber, Tal Shahar, Mona Dvir-Ginzberg, Marina Faerman, Ellen E. Quillen, Alexander Meissner, Yonatan Lahav, Leonid Kandel, Meir Liebergall, María E. Prada, Julio M. Vidal, Richard M. Gronostajski, Anne C. Stone, Benjamin Yakir, Carles Lalueza-Fox, Ron Pinhasi, David Reich, Tomas Marques-Bonet, Eran Meshorer, Liran Carmel, Differential DNA methylation of vocal and facial anatomy genes in modern humans, Nature Communications 11, 2020-03-04, עמ' 1189 doi: 10.1038/s41467-020-15020-6
- ^ Lily Agranat-Tamir, Shamam Waldman, Mario A. S. Martin, David Gokhman, Nadav Mishol, Tzilla Eshel, Olivia Cheronet, Nadin Rohland, Swapan Mallick, Nicole Adamski, Ann Marie Lawson, Matthew Mah, Megan Michel, Jonas Oppenheimer, Kristin Stewardson, Francesca Candilio, Denise Keating, Beatriz Gamarra, Shay Tzur, Mario Novak, Rachel Kalisher, Shlomit Bechar, Vered Eshed, Douglas J. Kennett, Marina Faerman, Naama Yahalom-Mack, Janet M. Monge, Yehuda Govrin, Yigal Erel, Benjamin Yakir, Ron Pinhasi, Shai Carmi, Israel Finkelstein, Liran Carmel, David Reich, The Genomic History of the Bronze Age Southern Levant, Cell 181, 2020-05-28, עמ' 1146–1157.e11 doi: 10.1016/j.cell.2020.04.024
- ^ https://academic.oup.com/bioinformatics/advance-article-abstract/doi/10.1093/bioinformatics/btab531/6322987?redirectedFrom=fulltext
- ^ https://www.bio.huji.ac.il/he/content/פרס-מילקן-2019-פרס-הרקטור-למצוינות-בהוראה-לפרופ-לירן-כרמל
32711676לירן כרמל