רבי יוחנן הקפיד ביותר על קיום מצוות עונה, ואף פירש את הפסוק בתחילת ספר תהילים: "וְהָיָה כְּעֵץ שָׁתוּל עַל פַּלְגֵי מָיִם אֲשֶׁר פִּרְיוֹ יִתֵּן בְּעִתּוֹ", שהכוונה היא על המשמש מיטתו מדי ליל שבת, כפי הנדרש מתלמידי חכמים. רבי יוחנן אף העיד על עצמו, כי עשה רפואה מסוימת (המפורטת בגמרא) שמטרתה להחזיר את כוח האדם לקיים ביאה במצוות עונה.
כל הקטע הנ"ל מיותר.
א. מצוות עונה היא מצוה מן התורה וכל יהודי חייב בה ובודאי שכל התנאים והאמוראים קיימו אותה ולא ראינו כאן איזה הקפדה מיוחדת אצל רבי יוחנן במצוה זו יותר משאר אמוראים. דוגמא לדבר וכי אם איזה תנא ידרוש דרשה על שילוח הקן נכתוב עליו שהיה מקפיד מאוד בזה הדבר לקיים מצות שילוח הקן.
ב. רבי יוחנן סך הכל פירש את הפסוק על זמן של ליל שבת. (אך לא על עצם מצות עונה כי עצם הדין הוא דין מפורש).
ג. יש מחלוקת בגמ' בב"ק פ"ב מי פירש את הפסוק הנ"ל וי"א שלא רבי יוחנן אמר זה.
ד. בכתובות ס"ב לא מוזכר רבי יוחנן כלל אלא אמוראים אחרים.
ה. מה שרבי יוחנן עשה איזה רפואה אין בזה שום הקפדה מיוחדת אלא כך צריך לנהוג כל אחד שצריך את הרפואה הזאת.